杨公墩在青沟玄君殿后。明万历9年（1581年），盐城知县杨瑞云开浚射阳湖，当地人民感念他的恩德，特将所挑之土垒为墩，名曰“杨公墩”，并刻碑纪念，碑文《杨公墩记》为宝应名士吴敏道（杨曾请其编修县志）所撰。
    射阳湖俗称谢阳湖。该湖起自宝应射阳镇，流经盐城青沟（今属阜宁）、东沟海陵溪，下至庙湾新丰市入海，全长三百余里，能受纳淮杨两郡七州县之水。故其时两郡无水患，丰年相仍，堪称乐国。明嘉靖之后，河患日剧，沙淤日深，加之大海东徙，由湖入海的旧渠也日渐增长，因之称为射阳河。原海陵故道渐浅，淮安诸水又截湖为堰，湖身淤积尤甚。苏家嘴柳浦、建义诸口先后溢决，挟沙入湖，致使湖身半成平陆。时黄河又南徙，夺高邮宝应的邗沟之堤，而下水并汇於射阳湖。于是夏秋湖涨，湖不能容纳，泛滥成灾，淹没民田，荡溺人畜；待冬春之际，则水落河底，不能驶十斛之舟，航运极为不便。附近州县深受其害，尤以盐城为甚。“射阳积雨千村哭，一村无存稻一斛。高邮湖堤又溃防，处处逃亡余破屋。尔今去此欲何依，天灾流行到处酷。”（《阜宁县志.艺文卷.逃亡行》）这首诗中所描绘的惨景，正是当时人民苦难生活的真实写照。
    杨公知盐城，关心人民疾苦。当他得知射阳湖水患甚烈时，遂倡议开浚，上书督府。万历7年（1579年），督府发帑，并调集文武官员负责开湖事宜，殚精竭虑，历尽艰辛。吴道敏有《杨公墩记》：“杨公墩在盐城之青沟镇，青沟父老为邑令杨公作也。射阳湖在盐城县治西140里，湖最巨且深，萦回三百余里，能受淮扬两郡七州县之水，旋转而入于海。故其时两郡无水患，而穰岁相仍称乐国。嘉靖以来，淮水夺淮之柳浦湾而下，黄河南徙，则又夺高宝之堤而下，并汇于射阳湖。日湔月洗，兼以黄河之水，停蓄淤积，于是射阳湖日就淤浅，非曩昔矣。夏秋水涨，则湖莫能容。崩腾泛溢，浸没民田。千里相望，渺如巨壑，所荡溺人畜，不可胜数，安复问禾黍！迨冬春水落，则水粼粼露湖底，不能运十斛舟，百货阻莫通，是商民俱病也。自是诸州县咸蒙其害，而盐城尤甚。万历7年，杨公至，乃始倡开射阳湖之议。白于督府凌公云翼，即具疏以请于上。于是督府发帑锾间，文武诸属吏分董之。而杨公挺然以身总其役，部署于卒，口授方略，日乘小舟，栖泊洲渚间。披寒雪，冒暑曦，至身且病，犹强治事，不少偷息。以万历9年正月始事，是年8月工成。湖既浚，水始湍驶，趋海如箭。即伏秋水发，亦且得所归，无汛溢患二十年。蛟龙所窟宅之田，一朝毕出，盐人咸把锄犁而耕。至秋，黄云蔽野，社鼓相闻。冬春之间，水虽落，中流尚深丈余，万斛之舟，杨帆鼓棹而行，百货毕至，海滨所产，咸得达于四方。于是青沟父老，于其镇之玄君殿后，树墩以识之，名曰‘杨公墩’。时万历10年也。”
    射阳湖竣工后，河水滔滔，经庙湾直泻大海。即使夏秋暴雨猛降，百川汇湖，亦无水灾之忧。由此可见，开浚射阳河，确是利及当时泽被后代的一大壮举。明出阳沈柿在《重经射阳湖有感呈杨大令瑞云》一诗中吟唱道：“忆昔曾为上湖客，湖天极目使人愁。风涛浩渺鱼龙卧，葭苇萧条鹳鹤游。一自桑麻开沃壤，几多篱落接沧州。羡君千载平成绩，太史重书大有秋。”（乾隆《淮安府志》）。
    明朝末年，由於该墩久塌，青沟镇人遂筹资增筑。寓贤陈云墀撰写了《重修杨公墩碑记》。
    四百多年后的今天，射水悠悠，浩浩东流，给里下河人民带来了舟楫之便，灌溉之利。当年的杨公墩及其碑文虽早已为历史的风云所湮没，但杨公的业绩仍留盐阜史册，光耀千秋。